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羊痘病毒(GaPV)核酸检测试剂(荧光PCR法,外源内标)
点击次数:299 更新时间:2024-08-07

羊痘病毒(GaPV)核酸检测试剂(荧光PCR法,外源内标


 

包装规格:48 T/

产品说明:

采用Taqman探针技术,以羊痘病毒(GaPV,羊痘病毒属包含绵羊痘病毒、山羊痘病毒和牛结节性皮肤病病毒等3种病毒)特异性保守基因为靶位点设计特异性引物和探针,用于样品中GaPV核酸的辅助检测。本产品引入了dUTP / UDG 系统,可降解含UssDNAdsDNA,消除由PCR产物导致的交叉污染。 同时设置阳性内对照 (即内标,使用VIC报告基团),通过检测内标是否正常来监测qPCR体系中是否含有 PCR抑制物,避免出现假阴性结果。

产品组成:


组分名称

主要成分

DV231Y-21-V1

1

GaPV PreMix-2

qPCR反应缓冲液、dNTPsUDG酶、Taq酶、引物、探针

960  μL/

2

GaPV阴性对照-2

无酶水

400  μL/

3

GaPV内标对照-2

含内标扩增片段的核酸

480  μL/

4

GaPV阳性对照-2

含目标扩增片段的核酸

50  μL/

注:不同批号产品的成分之间不可以混用或互换!!!

储存条件和保质期:

-20±5避光储存,有效期12月。干冰运输。重复冻融小于5次。生产日期,失效日期请见外包装盒。

适用仪器:

ABI7500宏石96PBio-Rad CFX96实时荧光PCR仪等。

样品要求:

1、适用样品类型

活体或剖检牛羊的皮肤丘疹、肺部病变组织、淋巴结、血液等样品

要求送检新鲜样品,禁止反复冻融!

2、样品处理(核酸提取区)

参照NY/T 541-2016 兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范》等标准进行样品前处理, 使用商业化的提取试剂盒提取样品中的核酸。提取时,每200 μL阴性对照处理后的样品溶液中添加10 μL内标对照,提取后的核酸应立即检测,否则冻存于-20±5,保存时间不超过6个月,禁止反复冻融

*内标对照的其它使用方:将内标对照混入 qPCR工作液中,但仅仅质控扩增过程和监测qPCR体系中是否含有 PCR抑制物,不能质控提取核酸过程

检测方法

为了防止污染,实验需分区操作!!!

注:核酸提取参照样品要求,在核酸提取区进行或在样品处理区进行。

1、试剂准备 (在试剂准备区进行)

(1) 推荐方式(内标对照质控核酸提取和核酸扩增过程)

取出试剂盒中的各组分以及自备试剂,室温放置,待温度平衡至室温,混匀后备用;

根据检测样品数量,建议每次检测均设置阴性对照和阳性对照。将所需数量(N)的GaPV PreMix-2分配到每个微离心管(如八连管)中,20 μL/管。待检样品数为n时,所需反应数N=样品数(n)+阳性对照(1)+阴性对照(1)

当准备使用时,再转移到样品处理区。

(2) 其它方式内标对照仅质控核酸扩增过程

根据所检测的样品数量按照下表配制反应液,建议每次检测均设置阴性对照和阳性对照。待检样品数为n时, 需配制反应体系数N=待检样品数(n) +阳性对照(1)+阴性对照(1)+1

*qPCR工作液配制表(其它方式)

组份

每反应体积(μL)

GaPV PreMix-2

20 μL×N

GaPV内标对照-2

0.5 μL×N

*注:本配制方法为在提取样品核酸未加内标对照时的补救方法,不推荐。

将配制好的qPCR工作液充分混匀后瞬时离心,待用;当准备使用时,将等量的20 μL分配到每个微离心管(如八连管)中,并转移到样品处理区。

2、样品加样 (在样品处理区进行)

 在每个PCR管中加入5 μL经提取的待测样品和阴性对照、阳性对照,盖上管盖, 瞬时离心,使液体全部沉于管底。

3qPCR扩增 (在扩增与分析区进行)

 (1) 荧光通道选择

荧光基团选择FAM通道检测GaPV;选择VIC 通道检测内标;淬灭基团设置为none。如ABI qPCR仪,还需设置Passive Referencenone。其它仪器参考仪器说明书。

(2) qPCR扩增程序设置

设置反应体系为25 μL

 

步骤

温度

反应时间

循环

UDG消化

50

5 min

1

预变性

95

30 sec

1

扩增

变性

95

5 sec

45

退火与延伸

60

35 sec,数据收集

4、结果分析 (ABI7500 qPCR仪为例)

反应结束后,qPCR仪将自动生成结果。若仪器自动生成的扩增曲线或阈值线有异常,用户可根据实际情况自行调整,基线Start值可以在 3~10,基线End值可设在 5~20,调整各扩增曲线的基线区相对水平即可。点击Analyze 进行分析。

5、质量控制

试剂盒中各控制项应符合下列要求,否则实验无效。


阳性对照

阴性对照

FAM通道GaPV

Ct32

Ct值或Ct>40

VIC通道

(内标)

Ct值或Ct>40

典型的S形曲线,Ct35

参考qPCR工作液配制表(其它方式)配制时,阳性对照的VIC通道应出现S型曲线,Ct35

检验结果的解释

(1)若样品的VIC通道呈典型的S形曲线且Ct35时,

A. FAM通道Ct35,判定为GaPV阳性

B. FAM通道Ct值在3540之间时,需要观察靶基因的扩增曲线是否呈S形,如果曲线呈S形,样品应视为疑似GaPV阳性,需重新检测;复测结果若Ct值≦40且具有典型S形曲线,判定为GaPV阳性;反之若为无Ct显示Ct>40或无典型S形曲线,则判定为GaPV阴性。

C. FAM通道Ct>40,判定为GaPV阴性

2)如果VIC通道的Ct值高于35,而没有显示明显的S形扩增曲线,原因如下:

1) 样品中存在PCR抑制剂,建议实验前稀释模板

2) 核酸提取操作存在缺陷,建议重复核酸提取进行检测

3) 在处理过程中没有获得合格的样品,或者在运输和储存过程中样品已经降解,建议重新采样。

检验方法的局限性

1) 阴性结果可能是由于从样品中提取的核酸质量低,储存条件不当,储存期不合适,样品中存在抑制剂,核酸降解和核酸提取方法的提取效率差等原因。

2) 不合理的样品采集、运送与保存条件,样品中病毒含量过低,或不合理的实验操作和环境很可能造成假阴性或假阳性结果。其它临床观察和相关资料应结合测定,必要时再次进行检测。

3) 由于突变或其它原因,靶序列的序列变化可能会产生假阴性结果。

注意事项:

1) 本产品仅用于科研使用,使用前请仔细阅读本说明书。

2) 实验前请熟悉和掌握需使用的各种仪器的操作方法和注意事项,对每次实验进行质量控制。

3) 实验室管理需严格遵照PCR基因扩增实验室的管理规范,实验人员必须进行专业培训,实验过程严格分区进行, 所有消耗品仅作一次性使用,实验操作的每个阶段使用专用仪器和设备,各区各阶段用品不可交叉使用。

4) 所有检测样品均视为具有传染性的物质,实验过程中穿工作服并经常更换手套,以避免样品间的交叉污染;

5) 样品操作、废弃物处理应符合相关法规要求:《微生物生物医学实验室生物安全通用准则》和《医疗废物管理 条例》。

6) 所有试剂 (包括本产品中的组分与客户自备试剂) 使用前均需彻底化冻、混匀。

7) 液类样品溶血严重时,会使扩增曲线高度显著下降。因此,当使用该试剂盒同时检测血样品原液和生理盐水稀释 样品时,建议对2类模板分别设置不同的阈值线,以保证结果的准确性。

8) 当出现多个样品的Ct>40时,可能是qPCR仪自动生成的阈值线较高的原因,建议将阈值线高度设置在扩增曲线 最大荧光值的1/15左右后,重新分析。

本产品仅供科研使用,检测结果不能用作临床诊断判断唯一依据

2011年开始我们致力于在生命科学领域生物医学实验技术及论文润色服务,协助客户各类实验服务及论文润色十多年,是您值得信赖的科研合作伙伴!

如果您受时间、试验条件等限制而无法完成您的课题研究,欢迎您与我们联系。

 

实验技术服务:

 


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